MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV03

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009341	AGGA	2	8	28	35	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009341	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009341	GGT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009341	CCCT	2	8	111	118	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009341	GCG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
6	NC_009341	CGG	3	9	192	200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
7	NC_009341	ACC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
8	NC_009341	ACCC	2	8	223	230	25 %	0 %	0 %	75 %	145226198
9	NC_009341	CG	3	6	306	311	0 %	0 %	50 %	50 %	145226198
10	NC_009341	ATC	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226198
11	NC_009341	GTT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145226198
12	NC_009341	AGC	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226198
13	NC_009341	GCG	2	6	401	406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
14	NC_009341	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
15	NC_009341	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
16	NC_009341	GTC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226198
17	NC_009341	GCGG	2	8	525	532	0 %	0 %	75 %	25 %	145226198
18	NC_009341	CGG	2	6	603	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
19	NC_009341	CCG	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
20	NC_009341	ACC	2	6	698	703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
21	NC_009341	GCAC	2	8	761	768	25 %	0 %	25 %	50 %	145226198
22	NC_009341	GCCACC	2	12	774	785	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226198
23	NC_009341	CCG	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
24	NC_009341	TAG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226198
25	NC_009341	AC	3	6	846	851	50 %	0 %	0 %	50 %	145226198
26	NC_009341	GTG	3	9	966	974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009341	GCG	2	6	1010	1015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009341	CAGC	2	8	1027	1034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009341	ACC	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_009341	GGC	2	6	1055	1060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009341	GGCAC	2	10	1068	1077	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009341	TGA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226199
33	NC_009341	CGT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
34	NC_009341	GCG	3	9	1358	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
35	NC_009341	TGC	3	9	1374	1382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
36	NC_009341	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
37	NC_009341	CTT	2	6	1397	1402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226199
38	NC_009341	GGC	2	6	1416	1421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
39	NC_009341	CCG	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226199
40	NC_009341	GC	3	6	1438	1443	0 %	0 %	50 %	50 %	145226199
41	NC_009341	GCT	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
42	NC_009341	TGC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
43	NC_009341	CCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226200
44	NC_009341	TC	3	6	1534	1539	0 %	50 %	0 %	50 %	145226200
45	NC_009341	GT	3	6	1620	1625	0 %	50 %	50 %	0 %	145226200
46	NC_009341	GCC	2	6	1646	1651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
47	NC_009341	TCA	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226200
48	NC_009341	CGG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226200
49	NC_009341	GCC	2	6	1869	1874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
50	NC_009341	GTC	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
51	NC_009341	GC	3	6	1946	1951	0 %	0 %	50 %	50 %	145226200
52	NC_009341	TCG	3	9	2112	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
53	NC_009341	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
54	NC_009341	CGA	3	9	2170	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226200
55	NC_009341	TGG	3	9	2221	2229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226200
56	NC_009341	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009341	GTAA	2	8	2353	2360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009341	ATGT	2	8	2363	2370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009341	CG	3	6	2419	2424	0 %	0 %	50 %	50 %	145226201
60	NC_009341	CGC	3	9	2437	2445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
61	NC_009341	GCC	2	6	2471	2476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
62	NC_009341	GCC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
63	NC_009341	GCT	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226201
64	NC_009341	CCG	2	6	2545	2550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
65	NC_009341	GGC	2	6	2563	2568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
66	NC_009341	GCG	2	6	2569	2574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
67	NC_009341	ATG	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226201
68	NC_009341	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
69	NC_009341	ACGGC	2	10	2627	2636	20 %	0 %	40 %	40 %	145226201
70	NC_009341	AGA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226201
71	NC_009341	GGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
72	NC_009341	CGC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
73	NC_009341	GGCG	2	8	2778	2785	0 %	0 %	75 %	25 %	145226201
74	NC_009341	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226201
75	NC_009341	AG	3	6	2981	2986	50 %	0 %	50 %	0 %	145226201
76	NC_009341	TG	3	6	3001	3006	0 %	50 %	50 %	0 %	145226201
77	NC_009341	GGT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009341	AGG	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009341	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
80	NC_009341	ATC	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
81	NC_009341	AGC	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
82	NC_009341	GGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226202
83	NC_009341	GCC	2	6	3289	3294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
84	NC_009341	CGA	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
85	NC_009341	ACT	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
86	NC_009341	GTC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
87	NC_009341	GGCG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	145226202
88	NC_009341	AGTGC	2	10	3470	3479	20 %	20 %	40 %	20 %	145226202
89	NC_009341	CTT	2	6	3492	3497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226202
90	NC_009341	CGC	2	6	3500	3505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
91	NC_009341	GCC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
92	NC_009341	TGC	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
93	NC_009341	AGG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226202
94	NC_009341	GTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226202
95	NC_009341	AGA	2	6	3744	3749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226202
96	NC_009341	CGG	2	6	3843	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
97	NC_009341	CCG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226203
98	NC_009341	CGG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
99	NC_009341	GTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
100	NC_009341	ACCG	2	8	3907	3914	25 %	0 %	25 %	50 %	145226203
101	NC_009341	TGA	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226203
102	NC_009341	CTG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226203
103	NC_009341	CGA	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226203
104	NC_009341	GGC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
105	NC_009341	GTG	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
106	NC_009341	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
107	NC_009341	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226203
108	NC_009341	AGG	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226203
109	NC_009341	CCGGC	2	10	4418	4427	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_009341	CTCGAT	2	12	4567	4578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145226204
111	NC_009341	ATTG	2	8	4580	4587	25 %	50 %	25 %	0 %	145226204
112	NC_009341	GCC	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
113	NC_009341	AGT	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226204
114	NC_009341	GC	3	6	4735	4740	0 %	0 %	50 %	50 %	145226204
115	NC_009341	CTC	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226204
116	NC_009341	CCG	2	6	4830	4835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
117	NC_009341	GCG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
118	NC_009341	CGG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
119	NC_009341	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
120	NC_009341	AGA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226204
121	NC_009341	AGC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
122	NC_009341	ACG	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
123	NC_009341	TGG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226204
124	NC_009341	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
125	NC_009341	CGA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
126	NC_009341	GC	3	6	5261	5266	0 %	0 %	50 %	50 %	145226205
127	NC_009341	CGG	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
128	NC_009341	GCG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
129	NC_009341	CTGGA	2	10	5297	5306	20 %	20 %	40 %	20 %	145226205
130	NC_009341	GC	3	6	5342	5347	0 %	0 %	50 %	50 %	145226205
131	NC_009341	CCG	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226205
132	NC_009341	GATCA	2	10	5408	5417	40 %	20 %	20 %	20 %	145226205
133	NC_009341	AGG	2	6	5421	5426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226205
134	NC_009341	TGG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226205
135	NC_009341	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226205
136	NC_009341	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226205
137	NC_009341	TGC	3	9	5667	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
138	NC_009341	CGCC	2	8	5694	5701	0 %	0 %	25 %	75 %	145226205
139	NC_009341	ACG	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
140	NC_009341	TG	3	6	5738	5743	0 %	50 %	50 %	0 %	145226205
141	NC_009341	GAC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
142	NC_009341	CTG	2	6	5873	5878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
143	NC_009341	TCG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
144	NC_009341	CG	3	6	6026	6031	0 %	0 %	50 %	50 %	145226206
145	NC_009341	CGC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226206
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148	NC_009341	GC	3	6	6382	6387	0 %	0 %	50 %	50 %	145226206
149	NC_009341	CGCA	2	8	6447	6454	25 %	0 %	25 %	50 %	145226206
150	NC_009341	GCCC	2	8	6480	6487	0 %	0 %	25 %	75 %	145226206
151	NC_009341	CACGT	2	10	6515	6524	20 %	20 %	20 %	40 %	145226206
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154	NC_009341	CG	4	8	6603	6610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_009341	GAT	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_009341	AGGA	2	8	6722	6729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009341	ACC	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_009341	GCC	2	6	6807	6812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_009341	CA	3	6	6856	6861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_009341	CGA	2	6	6872	6877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009341	GCG	2	6	6881	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_009341	CGC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_009341	ACG	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_009341	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226208
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258	NC_009341	CGC	2	6	10109	10114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226208
259	NC_009341	GTCA	2	8	10171	10178	25 %	25 %	25 %	25 %	145226209
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262	NC_009341	CAC	2	6	10345	10350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226209
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269	NC_009341	GCC	2	6	10469	10474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226209
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271	NC_009341	GCCT	2	8	10513	10520	0 %	25 %	25 %	50 %	145226209
272	NC_009341	CCGCGG	2	12	10676	10687	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
273	NC_009341	GC	3	6	10721	10726	0 %	0 %	50 %	50 %	145226210
274	NC_009341	CTG	2	6	10753	10758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226210
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398	NC_009341	CGG	2	6	15131	15136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
399	NC_009341	CGG	2	6	15150	15155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
400	NC_009341	GGT	2	6	15160	15165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226211
401	NC_009341	CGG	2	6	15179	15184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
402	NC_009341	CGG	2	6	15236	15241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
403	NC_009341	CGG	2	6	15252	15257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
404	NC_009341	GCG	2	6	15288	15293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
405	NC_009341	GCA	2	6	15308	15313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226211
406	NC_009341	TCG	2	6	15431	15436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_009341	CCT	2	6	15546	15551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226212
408	NC_009341	GGCG	2	8	15564	15571	0 %	0 %	75 %	25 %	145226212
409	NC_009341	GATC	2	8	15714	15721	25 %	25 %	25 %	25 %	145226212
410	NC_009341	GCA	2	6	15728	15733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226212
411	NC_009341	GCA	2	6	15785	15790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226212
412	NC_009341	CGA	2	6	15846	15851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226212
413	NC_009341	TGT	2	6	16060	16065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_009341	GC	3	6	16079	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
415	NC_009341	GTC	2	6	16103	16108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_009341	GTC	2	6	16163	16168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_009341	CCTG	2	8	16197	16204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
418	NC_009341	CG	3	6	16294	16299	0 %	0 %	50 %	50 %	145226213
419	NC_009341	GGT	2	6	16312	16317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226213
420	NC_009341	AGG	2	6	16346	16351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226213
421	NC_009341	TGA	2	6	16365	16370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226213
422	NC_009341	CGC	2	6	16392	16397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226213
423	NC_009341	GCTC	2	8	16431	16438	0 %	25 %	25 %	50 %	145226213
424	NC_009341	CTT	2	6	16578	16583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_009341	AGCG	2	8	16643	16650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.